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沙门菌属（Salmonella，简称沙门菌）广泛分布于自然界，寄生于人和动物体内，亦常见于污染的蛋、奶及其制品、肉类、食品、饲料、水产品和污水等外环境，是最常见病原菌之一，可引起人类伤寒、副伤寒、胃肠炎、败血症和局部感染等诸多疾病。
根据沙门菌的抗原菌体O抗原和鞭毛H抗原的不同，沙门菌可分为A、B、C、D、E…等67个群、2500多种血清型，其中对人类致病的主要是A～F群。
引起伤寒的病原菌是伤寒沙门菌（Salmonella typhi），属D群沙门菌；引起副伤寒的病原菌包括甲型副伤寒沙门菌（Salmonella typhi A）、乙型副伤寒沙门菌（Salmonella typhi B）、丙型副伤寒沙门菌（Salmonellatyphi C)，分别归属于A群、B 群和C群。伤寒和副伤寒属我国法定乙类传染病，两者的传染源多为病人和带菌者。伤寒可引起严重的全身感染性疾病，起病多缓慢，症状主要为：持续发热、相对缓脉、全身中毒性症状与消化道症状、肝脾肿大和玫瑰疹等，最主要的并发症为肠出血、肠穿孔。甲、乙型副伤寒沙门菌与伤寒沙门菌的菌体抗原相同，鞭毛抗原各自不用，引起的症状与伤寒相似，但一般症状较轻、病程较短、病死率较低。丙型副伤寒沙门菌有特异性鞭毛抗原，其菌体抗原与伤寒沙门菌的菌体抗原亦无交叉免疫反应性，引起的症状酷似败血症，常呈现急性发病，出现寒战、高热，体温多呈驰张热型。同时，较常出现支气管肺炎、中毒性心肌炎、中毒性肝炎等并发症，但肠出血和肠穿孔很少见。
伤寒、副伤寒、痢疾之外的感染性腹泻（其他感染性腹泻）属我国法定丙类传染病。最常见引起其他感染性腹泻的沙门菌主要是鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌等。此外，引起其他感染性腹泻的病原体众还有副溶血弧菌、空肠弯曲菌等。
在各级医疗机构网络报告实验室确诊伤寒、副伤寒和感染性腹泻病例时，需在病例报告卡备注栏注明病原菌的名称，如伤寒报告病例应注明伤寒沙门菌，副伤寒报告病例注明甲型、乙型或丙型沙门菌，其他感染性腹泻病例则根据实验室检验结果注明是鼠伤寒沙门菌、肠炎沙门菌或副溶血弧菌等病原菌名称。